多维尺度分析(MDS)
多维尺度分析(MDS)将数据投影到点之间给定距离的平面上
输入
- 数据:输入数据集
- 距离:距离矩阵
- 数据子集:实例的子集
输出
- 选定数据:从图中选择的实例
- 数据:具有 MDS 坐标的数据集
功能
多维尺度分析可找到点的低维(在我们的情况下为二维)投影,并尝试将点之间的距离拟合地尽可能好。由于数据是高维的,或者距离不是欧几里得的,因此通常无法获得完美的拟合。
在输入,小部件需要数据集或距离矩阵。当可视化行之间的距离时,还可以调整点的颜色,更改其形状,对其进行标记并在选择后输出它们。
该算法在对物理模型的模拟中以迭代方式移动这些点:如果两个点彼此之间太近(或太远),就会有力将它们分开(或一起)。 该点在每个时间间隔的变化对应于作用在其上的力的总和。
- 小部件在优化期间重新绘制投影。 最优化会在开始时自动运行,之后可以按开始。 -刷新:设置刷新可视化效果的频率。 它可以是“每次迭代”,“每5/10/25/50步”或“从不”(“无”)。设置较低的刷新间隔可使动画更具视觉吸引力,但如果点数较多,则动画速度可能会变慢。
- 可视化选项. 这些选项只在可视化行的时候有效. (在距离(Distances) 选择).
- 如果 自动发送 已打开,则数据子集会自动进行通信,否则您需要按 发送所选。
- 如果要将创建的图像保存到计算机,请按 保存图像。
- 生成报告
示例
上面的图形是使用以下简单模式绘制的。 我们用了 iris.tab 数据集。 使用距离(Distances)小部件,我们将距离矩阵输入 多维尺度分析(MDS) 小部件,我们可以在其中看到 Irisx 显示在二维平面。我们可以在数据表(Data Table) 中看到附加的坐标。
参考文献
Wickelmaier, F. (2003). An Introduction to MDS. Sound Quality Research Unit, Aalborg University. Available here.
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