Radviz

Radviz 可视化,具有探索性数据分析和智能数据可视化增强功能。

输入

  • 数据:输入数据集
  • 数据子集:实例的子集

输出

  • 选定数据:从图中选择的实例
  • 数据:带有附加列的数据,显示是否选择了一个
  • 成分:Radviz向量

功能

Radviz(Hoffman et al。1997)是一种非线性的多维可视化技术,可以显示二维投影中由三个或更多变量定义的数据。可视化变量表示为围绕单位圆周长等距分布的锚点。数据实例显示为圆内的点,其位置由物理隐喻确定:每个点都用弹簧固定在适当的位置,弹簧的另一端连接到可变锚点上。每个弹簧的刚度与相应变量的值成比例,并且该点最终在弹簧力处于平衡的位置。 在可视化之前,将变量值缩放为介于 0 和 1 之间。与一组变量锚点接近的数据实例对于这些变量的值要比其他变量更高。

下面显示的快照显示了 Radviz 小部件,具有可视化的功能基因组学数据集(Brown等,2000)。 在此特定的可视化中,数据实例根据相应的类别进行着色,而可视化空间根据计算出的类别概率进行着色。 请注意,特定的可视化很好地分隔了不同类的数据实例,使可视化变得有趣并且可能提供信息。

界面

  1. 显示的投影轴和其他可用轴。
  2. 通过使用 “建议特征” 优化投影。 此功能通过平均分类准确性为属性评分,并通过可视化同步更新返回得分最高的属性。
  3. 选择投影类型。
  4. 圆内的轴被隐藏。 圆半径可以使用滑块更改

  5. 调整图属性:
    • 设置抖动 以防止点重叠(特别是对于离散属性)。
    • 显示图例在右侧显示图例。 单击并拖动图例将其移动。
    • 显示颜色区域 按类别为图表着色(请参见下面的屏幕截图)。
  6. 选择,缩放,平移和缩放 是浏览图形的选项
  7. 如果勾选了 “自动发送”,则会自动传达更改。 或者,按 发送
  8. 保存图像 将创建的图像以.svg或.png格式保存到您的计算机。
  9. 生成报告。

参考文献

Hoffman, P. E. et al. (1997) DNA visual and analytic data mining. In the Proceedings of the IEEE Visualization. Phoenix, AZ, pp. 437-441.

Brown, M. P., W. N. Grundy et al. (2000). “Knowledge-based analysis of microarray gene expression data by using support vector machines.” Proc Natl Acad Sci U S A 97(1): 262-7.

Leban, G., B. Zupan et al. (2006). “VizRank: Data Visualization Guided by Machine Learning.” Data Mining and Knowledge Discovery 13(2): 119-136.

Mramor, M., G. Leban, J. Demsar, and B. Zupan. Visualization-based cancer microarray data classification analysis. Bioinformatics 23(16): 2147-2154, 2007.

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